Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnep1r1Q3UJ81 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms