Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zswim8Q3UHH1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zswim8Q3UHH1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms