Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms