Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc177Q3UHB8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms