Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arfgef3Q3UGY8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arfgef3Q3UGY8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms