Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc58Q3UGP9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms