Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Puf60Q3UEB3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Puf60Q3UEB3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms