Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf166Q3U9F6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf166Q3U9F6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf166Q3U9F6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf166Q3U9F6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf166Q3U9F6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf166Q3U9F6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Rnf166Q3U9F6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf166Q3U9F6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf166Q3U9F6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf166Q3U9F6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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