Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pag1Q3U1F9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pag1Q3U1F9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms