Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U1D9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms