Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Palb2Q3U0P1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms