Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hace1Q3U0D9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms