Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc17a7Q3TXX4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc17a7Q3TXX4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms