Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd1Q3TXS7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd1Q3TXS7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms