Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrrc28Q3TX51 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms