Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pip4p1Q3TWL2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms