Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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