Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Smarca4Q3TKT4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Smarca4Q3TKT4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca4Q3TKT4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca4Q3TKT4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms