Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Col24a1Q30D77 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col24a1Q30D77 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms