Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trpm1Q2TV84 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpm1Q2TV84 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpm1Q2TV84 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms