Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Vax1Q2NKI2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vax1Q2NKI2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms