Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chrna5Q2MKA5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms