Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q149G0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q149G0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q149G0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q149G0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q149G0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q149G0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q149G0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q149G0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q149G0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q149G0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q149G0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q149G0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms