Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT4

Zgrf1, Protein ZGRF1, mousemouse

Predictions only

Length 1,863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zgrf1Q0VGT4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zgrf1Q0VGT4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zgrf1Q0VGT4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zgrf1Q0VGT4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms