Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms