Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lmntd2Q0VET5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmntd2Q0VET5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms