Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TrioQ0KL02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TrioQ0KL02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms