Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnnm1Q0GA42 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnnm1Q0GA42 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnnm1Q0GA42 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms