Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q08AU9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q08AU9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q08AU9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q08AU9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q08AU9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q08AU9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.9 ms