Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ssrp1Q08943 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ssrp1Q08943 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms