Protein–RNA interactions for Protein: Q08288

Lyar, Cell growth-regulating nucleolar protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LyarQ08288 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LyarQ08288 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LyarQ08288 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LyarQ08288 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LyarQ08288 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LyarQ08288 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms