Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgm3Q08189 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgm3Q08189 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms