Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnn2Q08093 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms