Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AmbpQ07456 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AmbpQ07456 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms