Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Siah1bQ06985 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Siah1bQ06985 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Siah1bQ06985 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms