Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPINDOCQ05AH6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPINDOCQ05AH6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms