Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Caprin2Q05A80 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Caprin2Q05A80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms