Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnal1Q05A62 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms