Protein–RNA interactions for Protein: Q05685

Folr2, Folate receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr2Q05685 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Folr2Q05685 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Folr2Q05685 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms