Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox10Q04888 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms