Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sox8Q04886 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sox8Q04886 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms