Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1sQ02789 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna1sQ02789 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1sQ02789 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms