Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ly9Q01965 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms