Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbp1Q01514 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp1Q01514 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms