Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrcdQ00LT2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms