Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Apoa1Q00623 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa1Q00623 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms