Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pax8Q00288 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms