Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms