Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brca2P97929 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brca2P97929 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brca2P97929 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Brca2P97929 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms