Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama4P97927 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama4P97927 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama4P97927 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama4P97927 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama4P97927 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama4P97927 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms