Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AlkP97793 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AlkP97793 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AlkP97793 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlkP97793 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlkP97793 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlkP97793 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlkP97793 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlkP97793 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlkP97793 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlkP97793 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AlkP97793 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AlkP97793 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AlkP97793 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AlkP97793 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AlkP97793 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AlkP97793 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AlkP97793 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AlkP97793 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
AlkP97793 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AlkP97793 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms